R语言篇:R包的安装
上一篇简单介绍了如何在集群上搭建自己的R环境,本篇将继续在R环境中如何快速的安装R工具包。
一. 从镜像直接安装(推荐,依赖包会一起安装)
无论是在RGui或者Rstudio中都可以使用如下命令来安装R包,以heatmaply为例:
>>install.packages("heatmaply")
>>installed.packages() #查看已经安装的包
>>remove.package("包名") #移除已经安装的包
二.下载到本地安装
按名称排序:https://cran.r-project.org/web/packages/available_packages_by_name.html
按日期排序:https://cran.r-project.org/web/packages/available_packages_by_date.html
2. 下载
进入到包的列表页面,ctrl+F检索自己想要下载的包名称:
图一. 包列表页面
点击进入包的详情页:
图二. 包的详情页面
选择packages source,点击下载。
3. 安装
>>install.packages("/home/zxsx/Renv/source/heatmaply_1.11.tar.gz",repos=NULL,type="source") #第一个参数是包的路径
三.安装github上的包
注: 前面两种方式都找不到的包可以尝试此种方法。
1. 预先安装devtools
>>install.packages("devtools")
2. 加载devtools包
>>library(devtools)
3. 利用devtools的install_github安装github上的包
图三. d3heatmap的github页面
>>install_github("rstudio/d3heatmap")
安装完成。