Centos 8 操作系统安装 VirSorter2 方法
#####################################################################
#### __ __(_) _ __ ___ ___ _ __ | |_ ___ _ __ |___ \ ####
#### \ \ / /| || '__|/ __| / _ \ | '__|| __|/ _ \| '__| __) | ####
#### \ V / | || | \__ \| (_) || | | |_| __/| | / __/ ####
#### \_/ |_||_| |___/ \___/ |_| \__|\___||_| |_____| ####
#####################################################################1. 将 VirSorter2-2.1.tar.gz 和 db.tgz 拷贝到服务器上
从网盘下载数据和安装包：VirSorter2-2.1.tar.gz，db.tgz
链接：https://pan.baidu.com/s/1ezWu_aUW-Ndl6XGKhHVg-Q
提取码：a5ug
2. 解压文件
推荐拷贝至'/biostack/database/VirSorter2' 目录。
mkdir /biostack/database/VirSorter2
cp VirSorter2-2.1.tar.gz db.tgz /biostack/database/VirSorter2
tar -xzvf VirSorter2-2.1.tar.gz
tar -xzvf db.tgz
rm VirSorter2-2.1.tar.gz db.tgz
3. 安装缺失的python包
使用清华镜像
sudo pip install --no-warn-script-location -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple snakemake
sudo pip install --no-warn-script-location -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple ruamel.yaml
4. 安装数据库
cd /biostack/database/VirSorter2/VirSorter2-2.1
python setup.py install
5. 配置数据库路径
virsorter config --init-source --db-dir /biostack/database/VirSorter2/db #db为数据库的路径
6. 测试运行VirSorter
cd /biostack/database/VirSorter2/VirSorter2-2.1/test
virsorter run --use-conda-off -w test -d /biostack/database/VirSorter2/db -i 4seq.fa -j 40 all 参数解读：
--use-conda-off 使用本地环境-w 输出文件路径
-i 输入文件路径
-j 线程数
-d 数据库目录
all 执行所有模块