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这里以Windows系统为例

点击Download R for Windows后进入新页面点击base，

点击Download R 3.6.0 for Windows

点击后开始下载安装包（一个exe文件）

下载完R安装包（我下的按转包名称为：“R-3.6-win.exe”），之后双击开始安装，跟一般的软件安装一样，根据需要进行相关安装设置并不断点击下一步即可。

step1、选择安装位置，可点击浏览改成自己的安装路径。一般默认路径就行，如果C盘空间小，可以选择其他盘。

step2、安装组件

注意：根据自身电脑操作系统的位数选择，但64位系统可全选，因为64位向下兼容32位系统。

点击下一步开始安装，安装完成会在桌面生成一个快捷方式。双击打开就是R语言的交互界面了。

我的电脑》》右键》》属性》》高级系统设置

高级模块下选择环境变量

在系统变量中找到Path变量，点击编辑

在dos命令行窗口输入R，回车就进入R环境。

install.packages("package_name","dir")

dir:包安装的路径。默认情况下是安装在..\library 文件夹中的。可以通过本参数来进行修改，来选择安装的文件夹。

Bioconductor包的安装具体还要查看官方的安装函数,通过网站(https://www.bioconductor.org/)查询，比如limma包的安装：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager")BiocManager::install("limma")

1）linux环境编译运行：tar.gz文件

2）windows 环境编译运行 ：.zip文件

3）MacOS环境编译运行:.tgz文件

包安装后，如果要使用包的功能。必须先把包加载到内存中（默认情况下，R启动后默认加载基本包），加载包命令：

Library(“包名”)

Require(“包名”)

library(help="package_name")

主要内容包括：例如：包名、作者、版本、更新时间、功能描述、开源协议、存储位置、主要的函数

help(package = "package_name")

主要内容包括：包的内置所有函数，是更为详细的帮助文档

find.package() 或者 .path.package()

detach()

data(dsname, package="package_name")

data( package="package_name")

library()