R语言系列:R包安装
R包是R的灵魂!R之所以广受欢迎,一个很重要的原因就是它是免费提供各种包,而这些包解决了各类问题,正所谓“包”治百病。
所以首先,我们需要学会如何安装R语言程序包。
本次教程将会教你如何从CRAN、github、bioconductor来个来源安装包。
从R语言的网站CRAN安装
从CRAN安装包是R的默认方式,因为这是R自己的网站,使用install.packages()命令来安装即可。
install.packages("packagename")
在Rstudio中使用命令install.packages来安装包,括号中的引号内输入包的名字即可,比如要安装ggplot2包
install.packages("ggplot2")
github是最大的代码托管网站,大部分程序员会选择将代码托管在github上,所以从github上安装R包基本上是必然的。
首先安装R语言开发工具development tools
install.packages("devtools")
比如安装do包,do包是上传到我的github上面的,github用户名是yikeshu0611,所以安装的时候需要先指定来自哪个账户,再指定那个账户下的哪一个包,组合在一起就是yikeshu0611/do
install_github("yikeshu0611/do")
安装Bioconductor包
Bioconductor网站提供大量生物信息方面的R包,安装Bioconductor网站的包需要使用BiocManager包,所以首先需要安装BiocManager包。
install.packages('BiocManager')
使用install()命令来安装包,例如安装limma包
今天讲了从R的官网CRAN,github网站,bioconductor网站三个来源安装R包,这个在使用R的过程中,几乎是每天都会使用到的,今天就讲到这里,下次我们将如何调用R包。
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