R语言-单数据柱形图
包：ggplot2
单数据柱形图一般为一个样本X对应一个观测值value，以下列数据（df）为例，每个处理T对应一个浓度C，比较不同处理下的浓度：
例1：
ggplot(df, aes(T, C))+
geom_bar(stat="identity")
此时df中的T列为类别型变量，这种情况下的X轴向自变量的顺序默根据字母顺序排列，如图1。但是我们常常需要X按照给定顺序排列，因此需要用factor()将X转变为因子型，再进行绘图，如图2。
例2：
df$T=factor(df$T,levels=c("CK","BC","ZE","CO1","CO2","CO3"))
ggplot(df,aes(T,C))+
geom_bar(stat="identity",width =0.7)
##factor()将T转换为因子，参数levels用于手动对因子进行排序。
还有一种情况是要X的顺序遵循value值递增或递减的顺序排列，此时需要先对因子向量T根据C值进行排序，定义X变量顺序，再进行绘图，如图3。
例3：
order=sort(df$C, index.return = TRUE, decreasing = TRUE)
df$T=factor( df$T , levels = df$T [order$ix])
ggplot(df,aes(T,C))+
geom_bar(stat="identity",width =0.7)
##利用sort()对C列进行排序，decreasing参数用于控制递增或者递减；factor()将T转化为因子，顺序根据C值的的排序结果。
补充一下，对于一些顺序型号变量X，例如采样点1-10 (此处使用的数据为md)。此时对X列有两种选择，一种是作为numeric，另一种是作为character。X列作为numeric时，X轴刻度可能会被省略（1-10只被标出2.5,5, 7.5, 10），如图4。此时需要调整刻度，即添加函数scale_x_continuous(), 则会得到X轴刻度为1-10的图5。
例4：
ggplot(md,aes(x=sample,y=RI,fill=Metal))+
geom_bar(stat="identity",position="stack",width=0.7,fill="grey")+
scale_x_continuous (breaks=c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10))
##scale_x_continuous () 函数用于修改X轴刻度
另一种情况则是X列作为character时，默认会根据字母顺序排列，因此X轴顺序为1,10,2,3……，如图6。针对这种情况，处理方法同例2，将X列转换为因子。