技能软件|“分子翻译”——化学结构式图像识别

vlambda
2021-07-29

技能软件|“分子翻译”——化学结构式图像识别

药思享

秉承“总是在做药，经常去思考，偶尔来分享”的理念，致力打造一线药学人交流的平台，让世界听到我们青年药学人的声音。

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撰文 | 左右LR

编辑 | 左右LR

排版 | 小路

前言

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“分子翻译”——化学结构式图像识别

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2021年6月，国际制药公司百时美施贵宝发起的“百时美施贵宝-分子翻译”挑战比赛在著名数据科学竞赛平台Kaggle落下帷幕，中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心的“SIMM DDDC”队伍，在郑明月研究员和蒋华良院士的指导下，成功摘得比赛冠军。

分子翻译，即从图片中识别化学结构，并将其转化为文本形式的国际化合物标识。在AI制药愈加火爆的今天，生物医药大数据挖掘显得尤为重要，而分子翻译正是其中最具挑战性的问题之一。

而在2021年7月16日于上海举办的“首届AI药物研发创新研讨会——智慧加监管创新大会系列主题会议”上，蒋华良院士亦强调了“分子翻译”的重要性。

基于此，笔者整理了两个可以进行化学结构式图像识别的软件，以期方便大家使用，甚至有所改良。

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Indraw

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InDraw是一款由鹰谷自主创新和研发的化学结构式编辑器。有网页和客户端两种版本，免费且正版。（鹰谷创始人邓光辉，本科毕业于复旦大学，博士毕业于中国科学院上海药物研究所，师从蒋华良院士和柳红教授，从事药物设计与合成研究，曾任职于GSK（2008-2013年），作为核心骨干参与的2个新药项目进入临床研究，获得GSK杰出科学家奖等奖励。于2013年辞职创业，创办上海鹰谷信息科技（Integle））。

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